Основными целями деятельности Национальной Академии Наук Высшей Школы Казахстана являются:
— целенаправленное развитие науки и образования с использованием самых современных форм и методов работы;
— содействие государственной образовательной политике;
— определение и формирование альтернативных направлений и программ развития Высшей Школы Республики Казахстан;
— максимальное использование достижений и интеллектуального потенциала ВУЗов для гармоничного и всестороннего развития личности, повышения экономической мощи государства, благосостояния и духовного развития общества;
— содействие вхождению учебных ВУЗов Казахстана и работников образования и мировое научное и образовательное пространство;
— признание по линии Академии авторитета и заслуг ученых и работников образования Республики Казахстан по их конкретному вкладу и труду.